البكتيريا النافعة هي أحد أنواع البكتيريا التي تتواجد داخل جسم الإنسان حيث تجدها في الجهاز الهضمي وخاصة القولون بأعداد كبيرة جداً وتتواجد أيضاً في رحم المرأة وعند الأطفال والرضع، فإنها تساعد في تسهيل عملية الهضم وتقوم بحماية الجسم من الإصابة بكثير من الأمراض التي قد تنشأ عن تكاثر البكتيريا الضارة أو لسبب نقص البكتريا النافعة.
تتأثر البكتيريا النافعة بعدة عوامل مثل نوع الغذاء حيث أن الخضراوات والفواكه والحبوب واللاكتيولوز والاكتيتول والأنيولين وبعض السكريات الموجودة في لبن الأم تساعد علي نمو وتكاثر البكتيريا المفيدة في القولون وتنشطها بينما اللحوم تساعد علي تكاثر البكتيريا الضارة التي قد تؤثر علي صحة الإنسان.